多年來因統(tǒng)計上的困難，一直沒有確切的數(shù)字。1945年9月，英國隨軍記者博比·杰克遜認(rèn)為人數(shù)達(dá)到5萬。同月11日，《星洲日報·總匯報》引用日本占領(lǐng)馬來亞時期出版的《彼南日報》提供的數(shù)字，說“新加坡檢舉不良分子7萬余人”。

日本歷史學(xué)家永三郎在他的《太平洋戰(zhàn)爭》一書中，引用了1942年出版的《朝日東亞年報》提供的資料，也說新加坡被甄別出的華僑有7萬名。1946年5月，英殖民政府市民咨詢局進(jìn)行初步的登記，只查出2721名遇難者。在1947年3月10日開審的檢證案戰(zhàn)犯法庭上，控方只能根據(jù)登記所得，指控日軍屠殺了五千以上的華人。但咨詢局及華人團(tuán)體都認(rèn)為不止上述數(shù)目，由于“全家遭難或被難者原屬單身，或大人遇難只余童稚，均無從填報，或認(rèn)為無甚用處，不欲填報”，實際遇害人數(shù)要比登記數(shù)目大得多。

柔佛州蘇丹醫(yī)生班德拉博士在遞交給遠(yuǎn)東軍事法庭的書面證詞中就斷言：“我相信，在新加坡除去軍人外，有15萬以上的亞洲人被日本警察秘密處死或拷打致死”。另一方面，日本侵略者則極力壓低殺人數(shù)目，掩蓋罪行。當(dāng)時負(fù)責(zé)檢證而被指控的警備司令官河村三郎，供證他所負(fù)責(zé)的市區(qū)內(nèi)只有四五千人被殺，而其他五位被告不是堅持說不知道，就是矢口否認(rèn)曾經(jīng)大規(guī)模殺害過華人。

1983年，日本新版中學(xué)歷史教材經(jīng)日本政府審查后，將“檢證”被害人數(shù)由兩萬人改為六千人，這跟某些日本右翼分子極力壓低南京大屠殺遇害人數(shù)的做法如出一轍。然而，無論侵略者怎樣掩蓋真相，事實是永遠(yuǎn)改變不了的。1942年出版的日本《朝日東亞年報》早就提到過，當(dāng)年在新加坡共有七萬人被檢舉;根據(jù)歷史學(xué)家的考證，因“檢證”遇難的華人應(yīng)超過二萬五千名;而新加坡華人也一直都相信，被“檢證”殺害的華人當(dāng)在四五萬名之間。無論數(shù)字的多寡，都不能減免日軍大規(guī)模屠殺城市平民的深重罪孽。